स्ट्रैंड-सीक को शुरू में बहन क्रोमैटिड एक्सचेंजों का खुलासा करने के लिए एक उपकरण के रूप में प्रस्तावित किया गया था। व्यक्तिगत कोशिकाओं के लिए स्थानीयकृत होने वाली एक क्रिया होने के नाते, DNA एक से अधिक कोशिकाओं का अनुक्रमण इन प्रभावों को बिल्कुल बिखेर देगा और SCE घटनाओं की अनुपस्थिति का सुझाव देगा। इसके अतिरिक्त, क्लासिक एकल कोशिका अनुक्रमण तकनीक इन घटनाओं को विषम प्रवर्धन पक्षपाती और दोहरे-किनारा समवर्ती जानकारी के कारण दिखाने में असमर्थ हैं, जिससे स्ट्रैंड-सीक की आवश्यकता होती है। संदर्भ संरेखण जानकारी का उपयोग करते हुए, शोधकर्ता एक एससीई का खुलासा कर सकते हैं यदि विरासत में मिला टेम्पलेट की दिशा बदल जाती है।
कंजूसों की पहचान करना
गलत तरीके से बनाए गए कॉन्टेस्ट्स जीनोम में महत्वपूर्ण दरों पर मौजूद होते हैं (माउस के संदर्भ जीनोम में 1%)। स्ट्रैंड-सीक, पारंपरिक अनुक्रमण विधियों के दौरान, इन दु: खों को उजागर कर सकता है। गलत तरीके से मौजूद कंटेस्टेंट मौजूद होते हैं, जहां स्ट्रैंड इनहेरिटेंस एक होमोजीजियस स्टेट से दूसरे (उदा। डब्ल्यूडब्ल्यू टू सीसी या सीसी टू डब्ल्यूडब्ल्यू) में बदल जाता है। इसके अतिरिक्त, यह राज्य परिवर्तन प्रत्येक स्ट्रैंड-सीक लाइब्रेरी में दिखाई देता है, एक गलत प्रतियोगी की उपस्थिति को मजबूत करता है।
छवि 263A | बीएआइटी का उत्पादन, वाट्सन (डब्ल्यू, ग्रीन) और क्रिक (सी, नीला) दोनों किस्में के लिए रीड काउंट प्रदर्शित करता है। प्रत्येक पढ़ा जाने वाला बार बार रेफरेंस जीनोम के 200-kb बिन से संरेखित विश्लेषणों की संख्या दर्शाता है। यहां से, पैतृक टेम्पलेट स्ट्रैंड इनहेरिटेंस का अनुमान लगाया जाता है। जैसे कि, यदि बेटी सेल में 200-kb क्रोमोसोमल सेगमेंट की दोनों प्रतियों को पैरेंट सेल में वाटसन टेम्प्लेट स्ट्रैड्स से संश्लेषित किया गया है, तो यह क्रोमोसोमल क्षेत्र में विशुद्ध रूप से डब्ल्यू संरेखण का संकेत करने वाली एक बड़ी हरी पट्टी द्वारा दर्शाया जाएगा। साथ ही, टेम्पलेट स्ट्रैंड इनहेरिटेंस के समरूप और विषमलैंगिक राज्यों के बीच स्विच को बहन क्रोमैटिड एक्सचेंज (एससीई) के रूप में व्याख्या की जाती है। | Maia.smith / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_(BAIT)_Output.png) from Wikimedia Commons
लेखक : Yavor Mendel
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