एक जैविक प्रश्न से शुरू, ChIP-on-chip प्रयोग को तीन प्रमुख चरणों में विभाजित किया जा सकता है: पहला उपयुक्त सरणी और जांच प्रकार का चयन करके प्रयोग को स्थापित करना और लेआउट करना है। दूसरा, वेट-लैब में वास्तविक प्रयोग किया जाता है। अंतिम, चक्र के ड्राई-लैब भाग के दौरान, एकत्रित डेटा का विश्लेषण या तो प्रारंभिक प्रश्न का उत्तर देने के लिए किया जाता है या नए प्रश्नों का नेतृत्व किया जाता है ताकि चक्र फिर से शुरू हो सके।
वर्कफ़्लो का वेट-लैब पार्ट
पहले चरण में, ब्याज की प्रोटीन (पीओआई) साइट से जुड़ा हुआ है DNA 2 ए 2 साइट इन विट्रो वातावरण में बांधता है। कस्टम रूप से यह एक सौम्य फॉर्मेल्डिहाइड निर्धारण द्वारा किया जाता है जो गर्मी के साथ प्रतिवर्ती है।
फिर, कोशिकाओं को lysed किया जाता है और DNA को सोनिकेशन द्वारा या माइक्रोकोकल न्यूक्लियस का उपयोग करके हिलाया जाता है। इसके परिणामस्वरूप DNA खंडों के दोहरे फंसे हुए टुकड़े होते हैं, स्वाभाविक रूप से 1 kb या इससे कम लंबाई के। जिन्हें POI से क्रॉस-लिंक किया गया था, वे POI-DNA complex बनाते हैं ।
छवि 127A | ChIP-on-chip प्रयोग का वर्कफ़्लो अवलोकन । | Zirguezi / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_workflow_overview.svg) विकिमीडिया कॉमन्स से
लेखक : Milos Pawlowski
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