सामान्यतया, एक सामान्य थोक सेल आरएनए-अनुक्रमण (आरएनए-सीक) प्रयोग के लिए, दस मिलियन विश्लेषण उत्पन्न होते हैं और एक जीन 50 मिलियन प्रति kb प्रति विश्लेषण (RPKM) प्रति विश्लेषण की सीमा से अधिक माना जाता है। एक जीन के लिए जो 1kb लंबा है, यह 500 विश्लेषणों से मेल खाता है और पॉइसन वितरण की धारणा के तहत 4% की भिन्नता (CV) का न्यूनतम गुणांक है। 200, 000 mRNA वाले एक सामान्य स्तनधारी सेल के लिए, इस न्यूनतम सीवी मूल्य को प्राप्त करने के लिए कम से कम 50 एकल कोशिकाओं के अनुक्रमण डेटा को नियमन में रखा जाना चाहिए। हॉबीट, रिवर्स नकल की प्रभावकारिता और प्रयोगों में पेश किए गए एक और शोर के कारण अभिव्यक्ति विश्लेषण और सेल प्रकार की पहचान के सटीक रूप के लिए अधिक कोशिकाओं की आवश्यकता होती है।
एकल-कक्ष DNA टेम्पलेट स्ट्रैंड अनुक्रमण
सिंगल-सेल DNA टेम्प्लेट स्ट्रैंड सीक्वेंसिंग, या स्ट्रैंड-सीक, बेटी सेल के पैतृक टेम्पलेट स्ट्रैंड्स की चयनात्मक अनुक्रमण के लिए एक तकनीक है। इस तकनीक में कई अनुप्रयोग हैं, जिसमें अलगाव से पहले पैतृक सेल में बहन क्रोमैटिड एक्सचेंजों की पहचान, संदर्भ जीनोम के विश्लेषण के संरेखण के दौरान गलत संदंश की पहचान, और बहन क्रोमैटिड्स के गैर-यादृच्छिक अलगाव का आकलन शामिल है।
छवि 261A | एकल-कक्ष RNA अनुक्रमण वर्कफ़्लो | Yijyechern / Attribution-Share Alike 3.0 Unported | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:RNA-Seq_workflow-5.pdf) from Wikimedia Commons
लेखक : Yavor Mendel
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